Hallo,
also, man sollte es tunlichst vermeiden, auf den Partitionen zu arbeiten, dies bringt erfahrungsgemäß immer Probleme mit sich.
Sollte man dies gemacht haben, so bleibt nur, das RAID mit mdadm zu starten und die "verfuschte" Partition auszulassen (siehe mdadm Manpage), dann hat man die saubere Mirrorpartition und kann hier die Änderungen vornehmen.
Dann sollte man, am besten direkt im RescueSystem, das Raid wieder aufbauen (Man kann mit dem Force Parameter dies auch erzwingen, wenn man weiss, was man tut).
Dann sollte das Array wieder clean sein und auch die Daten sollten nun korrekt sein.
Alternativ, kann man die Konfiguration umbauen auf die 2. HDD (sdb), beachten Sie hierbei aber, das auch der Bootsektor der 1HDD genutzt wird und es so zu Verwirrungen/Fehlern kommen kann, wenn die 1. HDD keine korrekte Grub Datei enthält.
Oder sollte es wirklich zu unübersichtlich werden, Rescue starten, Daten sichern und ReInstall durchführen.
HTH, Timo